Στο πλαίσιο του οράματος για την προώθηση της εκπαίδευσης, αλλά και την υποστήριξη της δημόσιας, πολιτιστικής και επιστημονικής ζωής στην περιοχή της Νοτιοανατολικής Ευρώπης, το Ίδρυμα Κόκκαλη ανέλαβε μία σειρά από πρωτοβουλίες με σκοπό, μεταξύ άλλων, την ενίσχυση της επιστημονικής έρευνας, την ανάπτυξη δικτύων προαγωγής της διεθνούς κατανόησης και της περιφερειακής συνεργασίας, την προώθηση και στήριξη των δημοκρατικών θεσμών διακυβέρνησης, την ανάδειξη της κοινωνίας της πληροφορίας, και την εξασφάλιση και ενίσχυση της τεχνογνωσίας στους τομείς της δημόσιας διοίκησης.  Στο ίδιο πλαίσιο, εντάσσεται και η ετήσια διάλεξη Athens Forum, η οποία φιλοξένησε σημαντικές προσωπικότητες από όλο τον κόσμο.